一般情况下，没有治疗扁平疣效果好的药物，患者可以在医生指导下使用维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏、重组人干扰素α2b凝胶等药物进行治疗。
1、维A酸乳膏
维A酸乳膏是一种角质溶解药，具有角质溶解的作用，可以使扁平疣的表皮细胞更好地脱落，从而起到治疗的作用。
2、咪喹莫特乳膏
咪喹莫特乳膏是一种局部外用的免疫调节药，具有一定的抗病毒作用，可以用于治疗扁平疣。
3、氟尿嘧啶软膏
氟尿嘧啶软膏是一种抗肿瘤的药物，可以抑制病毒DNA和RNA的合成，从而起到治疗扁平疣的作用。
4、重组人干扰素α2b凝胶
重组人干扰素α2b凝胶具有一定的抗病毒作用，可以抑制病毒的复制，从而起到治疗扁平疣的作用。
5、物理治疗
对于扁平疣数目较少，病情较轻的患者，可以通过激光、冷冻等物理治疗的方式进行治疗。
建议患者在医生指导下使用药物，避免自行用药，以免出现不良反应，导致病情加重。在日常生活中，患者要注意个人卫生，保持皮肤清洁干燥，避免用手抓挠患处，以免皮肤破损，引起感染。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。
北京大学第三医院
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三级甲等 综合医院 公立
上海交通大学医学院附属瑞金医院
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首都医科大学附属北京儿童医院
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转移因子胶囊
用于治疗病毒性感染和自身免疫性疾病：1.皮肤病；扁平疣，带状疱疹，单纯疱疹，两周为一个疗程；银痟病，尖锐湿疣等，三个月为一个疗程；2.呼吸道疾病；反复感冒，支气管炎，哮喘，慢性支气管炎，过敏性鼻炎，流行性腮腺炎等，两周一个疗程；3.病毒性肝炎，肝硬化，流行性出血热等，三个月一个疗程；4.其他：（1）肾病综合征，类风湿性关节炎，过敏性紫癜，硬皮肤，红斑浪疮，溃疡病等，三个月一个疗程。（2）恶性肿瘤，肿瘤病人放化疗后的辅助治疗，一个月一个疗程。
五妙水仙膏
本品具有去腐生新，清热解毒的作用。主治扁平疣、各种痣、寻常疣(瘊子)、老年斑、血管瘤、汗管瘤、皮赘等皮肤疾病。
维A酸片
适用于痤疮、扁平苔藓、白斑、毛发红糠疹和面部糠疹等。可作为银屑病、鱼鳞病的辅助治疗，也可用于治疗多发性寻常疣以及角化异常类的各种皮肤病。同时用于治疗急性早幼粒细胞白血病（APL），并可作为维持治疗药物。
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