细菌性肝脓肿有后遗症风险。由于细菌性肝脓肿可能导致肝脏组织的永久性损伤,如果不及时治疗或治疗不彻底,可能会留下后遗症,如肝硬化、肝功能减退等。因此,对于细菌性肝脓肿患者,应积极治疗并定期随访,以预防后遗症的发生。