男性HPV31阳性一般不需要用药治疗。因为HPV31属于低危型人乳头瘤病毒感染,主要通过性接触传播,通常不会导致严重的健康问题,而且具有自限性,多数情况下可以通过机体免疫系统自行清除。如果患者出现尖锐湿疣等临床症状,则需遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、氟尿嘧啶软膏等药物局部外敷来改善病情。虽然HPV31感染可能自愈,但建议定期复查以监测病毒状态,特别是在有生殖器或肛门病变的情况下。