胃肠镜总体安全性较高，多数人仅出现短暂不适，真正造成严重伤害的情况较少。风险大小与年龄、基础疾病、是否麻醉、是否做活检或治疗等密切相关，个体差异明显。
常见副作用多为轻微且可自行缓解。普通胃镜可能引起咽喉异物感、恶心、干呕；普通肠镜因充气可致腹胀、腹痛，检查后排气即可减轻。麻醉胃肠镜后可能有头晕、乏力、恶心，少数人醒后喉咙干痛。取活检或切息肉后，可能有少量黑便或大便带血，通常短期恢复。
少数情况下可能发生较严重并发症。消化道出血、穿孔虽罕见，但需内镜止血或外科处理；心肺负担加重、心律失常、误吸、感染等也可能出现，尤其高龄、心肺疾病、凝血异常或服用抗凝药物者风险更高。麻醉本身也存在过敏、呼吸抑制等风险，但规范操作下概率低。
检查前应如实告知病史和用药情况，由医生评估是否适合。选择正规医疗机构，术后按医嘱进食休息。若出现持续剧烈腹痛、呕血、黑便、发热、胸闷气促等，应及时就医。胃肠镜对发现早癌和息肉不可替代，不必因担心副作用而盲目拒绝，权衡获益与风险更合理。
常见副作用多为轻微且可自行缓解。普通胃镜可能引起咽喉异物感、恶心、干呕；普通肠镜因充气可致腹胀、腹痛，检查后排气即可减轻。麻醉胃肠镜后可能有头晕、乏力、恶心，少数人醒后喉咙干痛。取活检或切息肉后，可能有少量黑便或大便带血，通常短期恢复。
少数情况下可能发生较严重并发症。消化道出血、穿孔虽罕见，但需内镜止血或外科处理；心肺负担加重、心律失常、误吸、感染等也可能出现，尤其高龄、心肺疾病、凝血异常或服用抗凝药物者风险更高。麻醉本身也存在过敏、呼吸抑制等风险，但规范操作下概率低。
检查前应如实告知病史和用药情况，由医生评估是否适合。选择正规医疗机构，术后按医嘱进食休息。若出现持续剧烈腹痛、呕血、黑便、发热、胸闷气促等，应及时就医。胃肠镜对发现早癌和息肉不可替代，不必因担心副作用而盲目拒绝，权衡获益与风险更合理。
北京大学第三医院
上海交通大学医学院附属瑞金医院
首都医科大学附属北京儿童医院
