靶向代谢组学和非靶向代谢组学是研究生物体内小分子代谢物的两种主要方法。简单来说，靶向代谢组学侧重对已知特定代谢物进行精准定量分析，而非靶向代谢组学则全面扫描样本中所有可检测的代谢物，旨在发现未知变化。两者互为补充，共同用于疾病机制探索、生物标志物发现等领域。
靶向代谢组学通常针对预先选定的代谢通路或代谢物（如氨基酸、脂肪酸等），通过标准品建立精确的定量方法，检测灵敏度高、特异性强。这种方法适合验证某一假设，例如观察某个药物对特定代谢途径的影响，或者追踪某种疾病中已知标志物的浓度变化。但由于只关注有限目标，可能遗漏其他重要代谢物信息。
非靶向代谢组学采用高分辨质谱等技术，尽可能多地采集样本中代谢物的质谱信号，再通过统计分析和数据库比对来筛选差异代谢物。它不预设目标，适合探索性研究，比如发现新的疾病相关代谢物或未知的代谢通路。不过该方法数据量大、分析复杂，且无法对所有代谢物进行绝对定量，结果需进一步验证。
在实际应用中，两种方法常分阶段配合使用：先通过非靶向筛选找出潜在差异代谢物，再用靶向方法进行精准验证。需要注意的是，无论哪种方法，代谢组学结果都受样本处理、仪器条件、个体差异等因素影响，不能作为单一诊断依据。科研或临床解读时，应结合其他检查综合判断，避免过度依赖某一结果。
靶向代谢组学通常针对预先选定的代谢通路或代谢物（如氨基酸、脂肪酸等），通过标准品建立精确的定量方法，检测灵敏度高、特异性强。这种方法适合验证某一假设，例如观察某个药物对特定代谢途径的影响，或者追踪某种疾病中已知标志物的浓度变化。但由于只关注有限目标，可能遗漏其他重要代谢物信息。
非靶向代谢组学采用高分辨质谱等技术，尽可能多地采集样本中代谢物的质谱信号，再通过统计分析和数据库比对来筛选差异代谢物。它不预设目标，适合探索性研究，比如发现新的疾病相关代谢物或未知的代谢通路。不过该方法数据量大、分析复杂，且无法对所有代谢物进行绝对定量，结果需进一步验证。
在实际应用中，两种方法常分阶段配合使用：先通过非靶向筛选找出潜在差异代谢物，再用靶向方法进行精准验证。需要注意的是，无论哪种方法，代谢组学结果都受样本处理、仪器条件、个体差异等因素影响，不能作为单一诊断依据。科研或临床解读时，应结合其他检查综合判断，避免过度依赖某一结果。
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