一般情况下，男性生殖器畸形是否会导致阴茎完全缺失，需要根据畸形的具体情况进行判断。
一般情况下，阴茎畸形可分为阴茎部分缺失或完全缺失、阴茎弯曲、阴茎短小、尿道下裂等。如果男性生殖器部分缺失或完全缺失，但阴茎的发育正常，一般不会导致阴茎完全缺失。如果男性生殖器畸形的情况比较严重，可能会导致阴茎发育不良，就可能会导致阴茎完全缺失。
男性生殖器畸形可能是先天性发育异常、遗传等原因导致的，可能会影响到正常的性生活，也可能会导致心理障碍。建议患者可以去正规的医院进行检查，明确具体的情况，如果畸形的情况比较严重，患者可以在医生的指导下通过手术的方式进行治疗，如阴茎延长术、阴茎畸形矫正术等。
同时，患者在日常生活中要注意个人卫生，避免穿过紧的内裤，以免导致病情加重，同时还要保持愉悦的心情，避免过度紧张和焦虑。
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