三个月没有月经吃了黄体酮，小腹疼痛，可能是药物刺激引起的，但也可能是由于盆腔炎、子宫内膜异位症等疾病引起的。建议患者需要根据不同的原因采取相应的处理措施。
1、药物刺激
黄体酮属于一种孕激素药物，患者服用后可能会对胃肠道造成刺激，引起腹痛、恶心等不适症状。建议患者可以通过热敷的方式，促进局部血液循环，缓解不适症状。同时，患者也可以在医生指导下通过按摩的方式，缓解腹痛的情况。
2、盆腔炎
盆腔炎主要是由于感染、不洁性生活等因素引起的盆腔炎症性疾病。临床上一般会引起下腹部疼痛、阴道分泌物异常、异常阴道出血等症状。建议患者可以在医生指导下使用甲硝唑、左氧氟沙星等药物进行抗感染治疗。必要时，患者也可以遵医嘱通过手术的方式进行治疗。
3、子宫内膜异位症
子宫内膜异位症主要是由于子宫内膜异位到其他部位引起的，通常会引起下腹部疼痛、痛经、月经异常等症状。建议患者可以在医生指导下使用醋酸甲羟孕酮、甲地孕酮等药物进行治疗。必要时，患者也可以通过手术的方式进行治疗。
除此之外，还可能与子宫腺肌症、子宫肌瘤等疾病有关，建议患者及时就医，明确具体病因后对症治疗，以免延误病情。
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