生殖器疱疹典型症状为外生殖器或肛周出现簇集性水疱，疱液清亮，易破溃形成糜烂或浅表溃疡，常伴有局部疼痛、烧灼感或瘙痒。多数患者在发病前可有局部刺痛、麻木等前驱症状，随后出现皮损。部分人可能仅有轻微不适或无明显症状，但依然具有传染性。
初次感染时，症状往往较重，除局部皮损外，还可能伴发热、头痛、乏力等全身表现，腹股沟淋巴结可肿大压痛。水疱数目较多，愈合时间较长，通常需2至4周。复发感染时症状较轻，水疱较少，病程一般5至10天可自愈，但反复发作是常见特点。
该病具有潜伏期，通常为2至12天，平均4至5天。症状出现前，病毒已开始在局部复制，即使没有可见皮损，也可能通过性接触传播。症状的严重程度与个体免疫状态密切相关，免疫力低下者发作更频繁、皮损更重。
患病期间应注意保持局部清洁干燥，避免搔抓，穿着宽松内裤减少摩擦。由于病毒可长期潜伏在神经节内，即使症状消失，仍可能间歇性排毒。建议感染者与性伴侣充分沟通，必要时在无症状期也使用安全措施。规律作息、减轻压力有助于降低复发频率，但无法根除病毒。
初次感染时，症状往往较重，除局部皮损外，还可能伴发热、头痛、乏力等全身表现，腹股沟淋巴结可肿大压痛。水疱数目较多，愈合时间较长，通常需2至4周。复发感染时症状较轻，水疱较少，病程一般5至10天可自愈，但反复发作是常见特点。
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