真菌性巩膜炎通常无法自愈，需及时就医治疗。
真菌性巩膜炎是由于真菌感染导致的眼部炎症反应，由于真菌在眼部组织中繁殖，引发免疫应答，导致局部红肿、疼痛等症状，因此一般不能自愈好。如果确诊为真菌性巩膜炎，应立即就医，遵医嘱使用抗真菌药物进行治疗，如氟康唑、伊曲康唑等，以防止病情恶化。
若患者未得到适当治疗或延误治疗，可能会出现角膜穿孔、眼内炎等严重并发症，甚至可能导致失明。
建议定期复查，监测眼部状况，并遵循医生指导进行治疗和护理，避免自行用药或忽视症状。日常生活中注意个人卫生，保持眼部清洁，避免接触可能引起感染的物品。
北京协和医院
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盐酸布替萘芬喷雾剂
适用于浅部皮肤真菌感染，主要用于敏感菌所致的足癣、体癣、股癣。
余麦口咽合剂
彝医：麦枯息火。中医：滋阴降火。用于阴虚火旺、虚火上炎所致的口疮灼热、疼痛，局部红肿、心烦、口干，小便黄赤，以及复发性口腔溃疡见以上症状者。
那特真那他霉素滴眼液
5％的那他霉素适用于对本品敏感的微生物引起的真菌性睑炎、结膜炎和角膜炎，包括腐皮镰刀菌角膜炎。如同其他类型的溃疡性角膜炎那样，应根据临床诊断、涂片和角膜乔片培状等实验室检查，以及对药物的反应来确定真菌性角膜炎开始及持续治疗的时间。如有可能，应当在体外确定那他霉素抗有关的真菌的活性。单独使用那他霉素治疗真菌性眼内炎的有效性尚未确定。
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