先天性心内膜垫缺损术后有复发风险。由于心内膜垫缺损是一种先天性心脏畸形,手术治疗虽然可以改善症状,但并不能完全治愈。部分患者可能在术后出现心内膜垫再次发育异常,导致缺损复发。因此,术后定期随访和心脏超声检查非常重要,以监测病情变化并及时处理复发情况。