子宫内膜异位症不包括卵巢囊肿。子宫内膜异位症是指子宫内膜组织在子宫外的其他部位生长,如卵巢、输卵管、盆腔等处,引起疼痛和不孕等症状。而卵巢囊肿是卵巢上形成的液体或固体的包块,通常与月经周期无关,多数情况下是良性的。两者虽然都与女性生殖系统有关,但病因、症状和治疗方法都有所不同。