月经干净后第二天同房但是体外射精是否会怀孕，需要根据具体情况进行分析，可能不会怀孕，也有可能会怀孕。
如果月经干净后第二天，女性的月经周期比较规律，在排卵期时同房，并且没有采取避孕措施，通常是不会怀孕的。但如果女性的月经周期不规律，月经干净后第二天，一般不是排卵期，此时同房时如果没有采取避孕措施，也有可能会怀孕。
如果夫妻双方并没有生育的打算，在同房时一定要做好避孕措施，以免出现意外怀孕的情况。如果想要怀孕，可以在排卵期时适当增加同房次数，能够提高受孕的概率。如果不想怀孕，在同房时一定要做好避孕措施，以免对身体造成不必要的损伤。在日常生活中，备孕期间要注意饮食营养均衡，多吃一些优质蛋白的食物，同时也要戒烟戒酒。
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