早上起床大便两三次可能是正常现象，也可能是由于肠易激综合征、急性胃肠炎、慢性结肠炎、肠道息肉等原因引起的。
1、正常现象
如果患者在平时吃的食物过多或者是过快，可能会导致胃肠道蠕动加快，从而出现大便次数增多的情况。通常属于正常的生理现象，不需要特殊治疗，建议患者在日常生活中注意避免食用辛辣刺激的食物，如辣椒、花椒等，以免加重症状。
2、肠易激综合征
肠易激综合征是一种功能性胃肠病，可能与内脏高敏感性、胃肠动力异常等因素有关，患者可能会出现腹痛、腹胀、排便习惯改变等症状。建议患者可以在医生指导下使用双歧杆菌四联活菌片、乳酸菌素片等益生菌制剂进行治疗。同时，也可以遵医嘱使用蒙脱石散、盐酸洛哌丁胺胶囊等药物进行止泻治疗。
3、急性胃肠炎
急性胃肠炎主要是由于进食卫生不洁的食物，导致细菌感染胃肠道黏膜引起的。由于炎症刺激胃肠道黏膜，患者可能会出现腹痛、腹泻等症状，部分患者可能会出现早上起床大便两三次的情况。建议患者可以在医生指导下使用左氧氟沙星片、阿莫西林胶囊等药物进行抗感染治疗。同时，也可以遵医嘱使用乳酸菌素片、双歧杆菌三联活菌胶囊等药物进行调理。
4、慢性结肠炎
慢性结肠炎主要是由于遗传、感染等因素引起的结肠黏膜慢性炎症。由于炎症刺激结肠黏膜，患者一般会出现腹泻、黏液便、腹痛等症状，部分患者可能会表现为早上起床大便两三次的情况。建议患者可以在医生指导下使用美沙拉秦肠溶片、柳氮磺吡啶肠溶片等药物进行治疗。
5、肠道息肉
肠道息肉主要是由于遗传、年龄等因素引起的肠道黏膜表面隆起性病变。临床上一般会表现为便血、黏液便等症状，部分患者可能会出现早上起床大便两三次的情况。建议患者可以通过内镜下息肉摘除术的方式进行治疗。
在日常生活中，建议患者注意饮食清淡，避免进食辛辣刺激性食物，如辣椒、大蒜等。如果出现不适症状时，建议患者及时就医治疗。
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