咽喉痛，检查舌根后面有小的囊肿，可能是生理性因素引起的，也可能是咽炎、扁桃体炎、会厌囊肿、咽喉滤泡增生等原因导致的，可根据病因选择合适的治疗方式。
1、生理性因素
如果患者长期食用辛辣刺激的食物，可能会刺激咽喉部位，从而引起局部疼痛的情况。患者可能会出现咽喉部位有囊肿的情况，一般属于正常的生理现象，不需要进行特殊治疗。建议患者多喝水，注意清淡饮食，避免食用辛辣刺激的食物，通常可以缓解不适症状。
2、咽炎
如果患者长期处于污染的环境中，或者是长期吸烟，可能会刺激咽喉部位，从而引起咽炎。患者可能会出现咽喉部位疼痛、干燥、有异物感等症状，还可能会出现舌根部有囊肿的情况。建议患者可以在医生的指导下使用阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行治疗。患者也可以在医生的指导下通过雾化治疗的方式进行治疗。
3、扁桃体炎
若患者长期处于潮湿的环境中，可能会引起细菌感染，从而引起扁桃体炎。患者可能会出现咽部疼痛、发热、头痛、食欲不振、口臭等症状，还可能会出现舌根部有囊肿的情况。建议患者可以在医生的指导下使用罗红霉素胶囊、阿奇霉素胶囊等药物进行治疗。若患者扁桃体炎反复发作，可在医生的指导下进行扁桃体摘除术。
4、会厌囊肿
会厌囊肿是指发生在会厌黏膜下的囊肿，可能是由于先天性发育畸形、慢性炎症、机械刺激等因素引起的。当会厌囊肿较小时，一般没有明显的症状，当囊肿增大时，可能会出现咽部异物感、咽喉肿痛、吞咽困难等症状。患者可在医生的指导下使用阿奇霉素片、阿莫西林胶囊等药物来治疗。如果会厌囊肿比较大，可在医生的指导下通过手术切除的方式进行治疗。
5、咽喉滤泡增生
如果患者长期食用辛辣刺激的食物，可能会刺激咽喉部位，从而引起咽喉滤泡增生的情况。患者可能会出现咽部异物感、咽干、咽痛等症状，还可能会伴有舌根部有囊肿的情况。建议患者可以在医生的指导下使用清喉利咽颗粒、金嗓利咽颗粒等中成药进行治疗。同时，患者也可以遵医嘱通过激光治疗、液氮冷冻治疗等物理方式进行治疗。
患者平时需要注意多喝水，多吃新鲜的水果和蔬菜，如苹果、胡萝卜等，有利于病情的恢复。如果患者出现不适症状，建议及时前往医院就医治疗，以免延误病情。
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