阴茎根部往上有时会一阵一阵的痛，可能是由于性生活不当、外伤、龟头炎、尿道炎、前列腺炎等原因所导致，具体治疗需要根据病因而定。
1、性生活不当
性生活过于频繁或用力过度，可能会导致阴茎根部的肌肉组织受损，出现阴茎根部疼痛的现象。一般不需要特殊治疗，建议患者注意休息，避免过度劳累，通常一段时间后即可缓解。
2、外伤
如果阴茎根部受到撞击，可能会导致局部的软组织受到损伤，从而引起阴茎根部疼痛的症状。建议患者可以在受伤24小时内进行冷敷处理，可以促进局部毛细血管收缩，缓解疼痛症状。受伤24小时后可以进行热敷，可以促进局部血液循环，缓解疼痛症状。
3、龟头炎
龟头炎是指龟头部由外伤、感染、刺激等因素引起的阴茎头或阴茎包皮的炎症，患者可能会出现局部红肿、糜烂、溃疡等症状，还可能会伴有阴茎根部一阵一阵的疼痛的症状。建议患者可以在医生指导下使用硝酸咪康唑乳膏、伊曲康唑胶囊等药物进行抗真菌治疗。
4、尿道炎
尿道炎是指由淋球菌或非淋球菌等病原体引起的急、慢性尿道炎症，通常是由于不洁的性生活、尿道损伤等原因所引起，患者可能会出现尿道痒、尿频、尿痛等症状，还可能会伴有阴茎根部一阵一阵的疼痛的现象。建议患者可以在医生指导下使用阿奇霉素、青霉素等药物进行治疗。
5、前列腺炎
前列腺炎是指前列腺发生了炎症反应，可能与不注意个人卫生、长期饮酒、长期骑自行车等因素有关，患者可能会出现骨盆区域疼痛不适、排尿异常、性功能障碍等症状，还可能会伴有阴茎根部一阵一阵的疼痛的现象。建议患者可以在医生的指导下使用盐酸多西环素肠溶胶囊、阿奇霉素胶囊等药物进行治疗。
若患者出现不适，建议及时去医院就医，明确疾病，对症治疗。
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