通常情况下，怀孕42天留5天血，做彩超宫内没有胎囊，可能是受精卵着床晚、生化妊娠、宫外孕等原因引起的。
1、受精卵着床晚
受精卵着床晚一般是指受精卵形成后着床的时间比较晚，导致受精卵着床晚的原因可能是与平时月经不调或者是受精卵质量不好有关系。如果平时月经不调，可能会导致排卵期推迟，从而会导致受精卵着床晚。通常不需要特殊处理，注意观察，在怀孕50天左右做彩超检查就可以看到胎囊。
2、生化妊娠
生化妊娠是指受精卵结合后，并没有在子宫内着床，随着月经一起流产的现象。生化妊娠的病因目前尚不明确，可能与染色体异常、子宫内膜息肉、黄体功能不全等因素有关。一般患者没有明显的症状，部分患者可能会出现月经推迟、月经量增多等症状。如果是偶尔一次生化妊娠，一般不需要特殊处理，建议注意休息，避免过度劳累，一般会在下个月正常来月经。如果反复出现生化妊娠，建议患者及时就医，可以通过染色体检查、妇科彩超等方式明确病因，对症治疗。
3、宫外孕
宫外孕是指受精卵在子宫体腔以外的部位着床发育，宫外孕的病因可能与输卵管炎症、输卵管发育不良、避孕失败等因素有关。宫外孕的症状与受精卵着床部位、是否流产等因素有关。通常会出现阴道流血、腹痛等症状。如果输卵管妊娠没有发生破裂，出血量不多、生命体征平稳时，可以遵医嘱采取保守治疗，遵医嘱使用氨甲蝶呤进行治疗。如果出血量比较多，出现休克时，则需要采取手术治疗。
除此之外，还可能是先兆流产、胚胎停育等原因导致
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