包皮内测长了一个水疱，阴茎根部长了两个肉可能是珍珠状阴茎丘疹、生殖器疱疹、尖锐湿疣等原因引起的，需要根据不同的原因进行治疗。
1、珍珠状阴茎丘疹
珍珠状阴茎丘疹是一种常见的皮肤病，主要表现为阴茎冠状边缘和冠状沟出现珍珠状、半透明的丘疹，一般不会引起瘙痒、疼痛等症状。此类患者一般不需要进行特殊的治疗，如果影响美观，可以通过激光、冷冻等方法进行治疗。
2、生殖器疱疹
生殖器疱疹是一种常见的性传播疾病，主要表现为生殖器周围出现水疱、疼痛、瘙痒等症状。患者可以在医生的指导下使用阿昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦片等抗病毒药物进行治疗，也可以通过生理盐水清洗患处缓解不适。
3、尖锐湿疣
如果患者发生不洁的性行为或接触了尖锐湿疣患者的分泌物，可能会感染尖锐湿疣，出现丘疹、疼痛、瘙痒等症状。此类患者可以遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物进行治疗，也可以通过激光、冷冻等方法缓解不适。
除此之外，包皮内测长了一个水疱，阴茎根部长了两个肉还可能是梅毒等原因引起的，建议患者及时就医，可以通过体格检查、实验室检查等方式明确诊断。
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