炎性肠病抗体阴性，但肠镜下有溃疡，可能是肠道菌群失调、肠道感染、肠道慢性炎症、肠结核、克罗恩病等原因引起的，需要根据不同的原因选择针对性的治疗。
1、肠道菌群失调
如果患者长期服用抗生素、不健康饮食等，可能会导致肠道菌群失调，从而引起肠道黏膜损伤，出现腹泻、腹痛等症状。患者可以遵医嘱服用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗。同时，患者还可以适当进食富含膳食纤维的食物，如芹菜、玉米等，改善肠道菌群失调的情况。
2、肠道感染
如果患者不注意饮食卫生，可能会导致肠道感染，引起腹泻、腹痛等症状，部分患者可能会出现上述情况。患者可以在医生指导下使用阿莫西林、头孢呋辛酯等药物进行抗感染治疗。同时，患者也可以遵医嘱使用乳酸菌素片、双歧杆菌三联活菌胶囊等药物进行治疗。
3、肠道慢性炎症
如果患者本身患有溃疡性结肠炎、克罗恩病等疾病，可能会因炎症刺激肠道黏膜，引起肠道黏膜损伤，从而出现上述情况。患者可以在医生指导下使用美沙拉秦肠溶片、柳氮磺吡啶肠溶片等药物进行治疗。同时，患者也可以遵医嘱通过肠镜下切除溃疡性结肠炎、克罗恩病等病变肠道的方式进行治疗。
4、肠结核
肠结核是由结核分枝杆菌引起的肠道慢性特异性感染，属于肺外结核，常继发于肺结核，主要通过消化道传播。患者可能会出现腹痛、腹泻、便秘等症状，也可能会出现上述情况。患者可以在医生指导下使用利福平、异烟肼等药物进行抗结核治疗。必要时，患者也可以通过肠段切除吻合术等方式进行手术治疗。
5、克罗恩病
克罗恩病是一种原因不明的胃肠道慢性炎症性疾病，多见于末段回肠和邻近结肠，从口腔至肛门的各段消化道均可受累，呈节段性或跳跃式分布，患者可能会出现腹痛、腹泻、发热等症状，还可能会出现上述情况。患者可以在医生指导下使用美沙拉秦肠溶片、柳氮磺吡啶肠溶片等药物进行治疗。必要时，患者也可以通过结肠切除术进行手术治疗。
如果患者出现不适症状，建议及时就医，明确具体病因后进行对症治疗，以免延误病情。
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