宝宝三个月了还没有办出生医学证明，可以等宝宝六个月的时候再办理。
办理出生医学证明，是根据我国《母婴保健法》的规定，国家为了给宝宝建立健康的科学生活方式，需要提供健康证明书，证明宝宝身体健康，能够适应平民条理，办理出生医学证明。办理出生医学证明，需要宝宝的出生年月日，以及出生时的体重和身高的情况，如果宝宝是早产儿，或者是出生时体重比较轻，需要办理出生医学证明的时候，需要提供宝宝的出生年月日。同时还需要提供宝宝的母亲的出生证明，证明宝宝是在子宫内生长发育的，没有出生时的病史，证明宝宝是健康的。
在办理出生医学证明后，需要带宝宝去当地的医疗机构进行检查，检查宝宝的身体是否健康，并且还需要在医生的指导下，给宝宝进行一些身体的护理。
