怀孕自然流产两次，下次怀孕时可以在医生的指导下，通过B超检查、激素六项检查、染色体检查等相关的检查进行判断。
1、B超检查
自然流产可能是染色体异常或胚胎发育异常等原因导致的，如果两次自然流产之间没有伴随其他不适的症状，比如腹痛、阴道不规则出血等，一般不需要进行特殊的治疗。在此期间需要多注意个人卫生，以免滋生大量细菌出现感染的情况。
2、激素六项检查
激素六项检查主要是指卵泡生成素、黄体生成素、雌二醇、泌乳素、孕酮、睾酮等，可以了解女性内分泌是否正常，是否存在卵巢功能衰退的情况，从而判断是否容易再次自然流产。
3、染色体检查
染色体异常可能与遗传因素有关，如果存在染色体异常的情况，可能会出现自然流产的情况，此时可以通过染色体检查的方式进行判断。
除此之外，还可以通过B超检查等相关的检查进行判断，并且在医生的指导下采取针对性的治疗，以免影响正常的生育。
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