头部CT和核磁共振的区别主要在于检查方式不同、检查侧重点不同、检查时间不同等。
1、检查方式不同
头部CT是通过X线对头部进行扫描，而头部核磁共振是通过磁共振对颅脑进行检查。
2、检查侧重点不同
头部CT对于大多数颅脑病变有重要的诊断价值，如颅内肿瘤、脑出血、脑梗死等。而头部核磁共振对于软组织病变有较高的诊断价值，如脑外伤、脑梗死、脑肿瘤等。
3、检查时间不同
头部CT检查的时间比较短，一般几分钟就可以完成。而头部核磁共振检查的时间比较长，一般需要十几分钟。
除此之外，头部CT和核磁共振的检查设备、检查目的等方面也存在不同。
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