阿法骨化醇和骨化三醇都是治疗骨质疏松症的药物，它们的区别在于药理作用不同、不良反应不同、临床应用不同、药物相互作用不同、药物的价格不同，患者需要在医生指导下进行选择。
1、药理作用不同
阿法骨化醇是一种维生素D代谢调节剂，可以促进小肠和肾小管对钙的吸收，提高钙的转化率，从而提高血钙、血磷的水平。而骨化三醇是一种活性维生素D，可以促进钙的吸收，提高钙的转化率，从而提高血钙、血磷的水平。
2、不良反应不同
阿法骨化醇的不良反应主要有高钙血症、高尿酸血症、高磷血症、肾功能不全等。而骨化三醇的不良反应主要有面部潮红、瘙痒、口唇干裂、头痛等。
3、临床应用不同
阿法骨化醇主要用于治疗骨质疏松症、佝偻病、骨软化症、甲状旁腺功能减退症等疾病。而骨化三醇主要用于治疗绝经后和老年性骨质疏松症、甲状旁腺功能减退症、特发性甲状旁腺功能亢进症等疾病。
4、药物相互作用不同
阿法骨化醇与噻嗪类利尿剂、含钙药物、洋地黄糖苷、强心苷药物等合用时，会增加高钙血症的发生风险，因此应避免上述药物与阿法骨化醇合用。而骨化三醇与大剂量的含钙药物同时服用时，会影响骨化三醇的吸收，因此应避免上述药物与骨化三醇合用。
5、药物的价格不同
阿法骨化醇属于处方药，一般需要在医生的指导下，根据患者的病情严重程度，选择合适的剂量进行治疗，因此药物的价格也会有所不同。而骨化三醇属于非处方药，一般可以自行在药店进行购买，因此药物的价格也会相对较低。
患者在使用药物时，需要在医生的指导下进行，避免自行用药，以免出现不良反应，导致病情加重。
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