从抗生素种类来看,金霉素属于四环素类抗生素,对金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌、肺炎球菌、淋球菌均有抗菌作用。许多立克次体属、支原体属、衣原体属、非典型分枝杆菌属、螺旋体对金霉素敏感,红霉素属于大环内酯类抗生素,对革兰阳性菌有较强的抑制作用,对革兰阴性菌也有相当的抑制作用,对支原体、衣原体、立克次体等有抑制作用。金黄色葡萄球菌对红霉素易耐药。两者都具有抗菌作用,但抗菌谱略有不同。衣原体感染导致的沙眼选用红霉素较好。在功效方面,两种眼膏都主要治疗眼部感染,如沙眼、细菌性结膜炎、眼睑炎等。
金霉素眼膏的消炎作用较强,对眼部的刺痛效果较好,而红霉素的抗菌作用较强,对化脓以及沙眼衣原体效果较好。