无菌检查存在局限性缺陷一般是指无菌操作检查的过程中存在一定的局限性，通常与标本采集、运输、接收、处理等方面存在局限性。无菌操作检查是指在进行无菌操作检查之前，需要将无菌标本进行采集、运输、接收、处理等步骤，然后进行无菌检查，确保标本无菌，避免引起细菌感染。
1、标本采集
无菌操作检查需要采集患者的体液、排泄物、分泌物等进行化验，从而判断标本是否存在细菌感染的情况。通常采集的标本部位包括尿道口、阴道口、肛门等。
2、运输
无菌操作检查需要运送无菌标本，运输过程中需要避免接触不洁物品，以免影响检查结果。
3、接收
无菌操作检查需要使用相应的试剂进行检测，接收需要使用无菌操作检查专用容器，容器上应贴有标签，注明检查结果、检查时间、检查地点等，以免丢失。
4、处理
无菌操作检查结束后，需要使用消毒液对采集的标本进行消毒，同时需要及时送检。
此外，无菌操作检查还存在着检查时间短、检测结果不准确、无法进行特殊检查等局限性。因此，建议患者在日常生活中要注意自身的清洁，避免与他人共用私人物品，如浴巾、浴袍等，以免引起细菌感染的情况。如果患者在进行无菌操作检查的过程中出现了不适的症状，建议及时告知医生，并进行相关的检查，以免延误病情。