男性肛门疣一般可以挂肛肠科、皮肤科、肛肠外科、肿瘤科、传染科等科室进行就医治疗。
1、肛肠科
肛门疣通常是指发生在肛门部位的疣体，可能是人乳头瘤病毒感染引起的，通常会出现肛门部位瘙痒、疼痛等不适症状。患者可以及时到正规医院的肛肠科进行就医治疗，能够通过肛门镜检查、醋酸白试验等方式进行诊断，可以通过激光、冷冻等方式进行治疗。
2、皮肤科
肛门疣也可能是皮肤发生了病变，导致肛门部位出现了疣体，可以到正规医院的皮肤科进行就医治疗，可以通过皮肤镜检查、组织病理学检查等方式进行诊断，可以通过激光、液氮冷冻等方式进行治疗。
3、肛肠外科
肛门疣还可能是肛门部位的尖锐湿疣引起的，通常会出现肛门部位瘙痒、红肿、疼痛等不适症状，还可能会出现菜花状的赘生物。患者可以到正规医院的肛肠外科进行就医治疗，可以通过组织病理学检查、HPV-DNA检测等方式进行诊断，可以通过激光、冷冻等方式进行治疗。
4、肿瘤科
如果存在肛门部位的肿瘤，也有可能会出现肛门疣体的情况，此时可以到正规医院的肿瘤科进行就医治疗，可以通过CT检查、病理学检查等方式进行诊断，可以通过手术切除肿瘤的方式进行治疗，还可以通过放射疗法的方式进行改善。
5、传染科
如果患者存在尖锐湿疣等疾病，可能会通过性生活等途径进行传播，因此可以到正规医院的传染科进行就医治疗，可以通过醋酸白试验、皮肤镜检查等方式进行诊断，可以通过激光治疗、冷冻治疗等方式进行治疗。
患者在日常生活中也要注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物，如辣椒、大蒜等，同时也要避免食用发物，如牛肉、羊肉等。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。