硬脂酸镁一般具有过敏、损害免疫系统等副作用。部分人群对食品添加剂较为敏感,在使用硬脂酸镁后容易诱发过敏反应,出现胸闷、呼吸困难等不适症状。硬脂酸镁是一种免疫抑制剂,大量应用容易影响T细胞功能,而T细胞也属于胸腺淋巴细胞,有高度特异性的细胞表面抗原受体,所以如果长时间大量地使用硬脂酸镁,可能会降低人体的免疫系统功能。