肛门指检后一般会疼痛2-3分钟，具体时间需要根据患者的耐受程度进行判断。
肛门指检是一种常见的肛门检查方法，主要是检查肛门周围是否有异常增生的肿块、是否有肛裂、肛瘘、痔等疾病。由于在进行肛门指检时，需要将手指头伸入肛门内，可能会刺激局部黏膜，从而出现疼痛的情况。如果患者对疼痛的耐受程度比较好，一般在2分钟左右就可以结束检查。如果患者对疼痛的耐受程度比较差，可能需要3分钟左右才可以结束检查。
如果患者检查后出现疼痛的症状，建议可以在医生指导下使用温水坐浴的方式进行缓解。必要时，患者也可以在医生指导下使用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等非甾体抗炎药进行治疗。在日常生活中，患者要注意保持规律的作息，保证充足的睡眠，避免熬夜，同时要注意保持营养的均衡，避免吃辛辣油腻的食物，可以多吃一些富含蛋白质、维生素等营养物质的食物，如鸡蛋、西红柿等，有利于补充机体所需要的营养物质，还可以适当进行体育锻炼，如慢跑、游泳等，有利于提高机体的免疫力。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。
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