核磁共振一般能检查出囊肿是恶性还是良性，但不能单纯通过核磁共振进行判断，需要通过病理检查进行判断。
核磁共振是一种影像学检查，可以利用磁场与物体之间产生的磁场，从而对人体某部位进行断面扫描，能够检查出患者是否存在肿瘤、脑血管疾病、脑发育异常、脑部炎症等疾病。核磁共振可以用于检查脑部的肿瘤，但不能判断是良性肿瘤还是恶性肿瘤。因为核磁共振检查主要是通过磁场对人体组织进行扫描，如果存在肿瘤，一般会表现为异常信号，而如果是恶性肿瘤，一般会表现为异常的信号。
另外，患者也可以通过病理检查进行判断，病理检查是通过穿刺或切除等方法，从患者体内切取、钳取或穿刺等取出病变组织，然后进行病理检查，能够判断组织的性质，是良性肿瘤还是恶性肿瘤。
如果患者存在肿瘤，建议及时到正规医院的肿瘤科就诊，并积极配合医生治疗，以免延误病情。
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