肠系膜上动脉夹层动脉瘤主要是由真菌和细菌感染导致动脉滋养血管栓塞引发的,同时动脉粥样硬化也会影响中间层的弹性纤维。高血压、白塞氏综合征以及门静脉高压会损伤内膜,引发动脉壁肌层薄弱和破裂。腹部外伤有时可引起肠系膜动脉部分损伤,进而形成假性动脉瘤。肠系膜动脉瘤多发于肠系膜上动脉,而肠系膜下动脉瘤则相对罕见。