月经期间，只是用手在外面揉，直到流水，今天是第三天，

这跟手淫没有什么大的关系，月经持续时间并不是每次都一样的，3到7天都是属于正常范围，所以只要没有出现炎症感染，没有出现白带增多，那就没有什么关系。