早上醒来做腹式呼吸会感觉肚子疼痛可能是正常现象，也可能是胃肠功能紊乱、慢性胃炎等原因引起的，需要根据病因采取针对性的治疗措施。
1、正常现象
早上醒来时做腹式呼吸可能会导致腹部肌肉受到牵拉，容易出现疼痛的症状，一般不需要进行特殊的治疗，适当的进行按摩即可。
2、胃肠功能紊乱
胃肠功能紊乱的患者，可能会导致胃肠道的蠕动过慢，早上醒来时做腹式呼吸，可能会导致腹部疼痛。可以遵医嘱使用双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行调理。
3、慢性胃炎
慢性胃炎的患者，可能会导致胃黏膜受到损伤，早上醒来时做腹式呼吸，可能会导致疼痛的症状更加明显。可以遵医嘱使用奥美拉唑肠溶胶囊、雷贝拉唑钠肠溶胶囊等药物来治疗。
除此之外，还有可能跟消化性溃疡、急性胆囊炎等原因有关，需要及时就诊。
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