新生儿呕吐咖啡色分泌物可能是由于生理性因素、消化不良、急性胃炎等原因引起的，可根据不同的原因给予针对性治疗。
1、生理性因素
新生儿吃奶时可能会吸入大量的空气，或者是新生儿吃了含有铁剂的奶粉，可能会导致排出的大便呈现咖啡色。这种情况通常是正常的，无需特殊治疗，一般在新生儿吃完奶后，注意竖抱轻轻拍打新生儿的背部，来排出空气，可有效缓解该症状。
2、消化不良
新生儿消化、吸收能力比较弱，若是吃了难以消化的食物，可能会导致消化不良，出现腹胀、腹泻、呕吐等症状。这种情况下可以在医生的指导下服用枯草杆菌二联活菌颗粒、双歧杆菌三联活菌散等药物来治疗，能够有效缓解不适的症状。
3、急性胃炎
新生儿若是饮食不当或者是受到病原体的感染，可能会导致急性胃炎，出现腹泻、呕吐、发热等不适的症状。此时可以在医生的指导下服用蒙脱石散、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物来治疗，能够有效缓解不适的症状。
除以上原因外，还可能是胃溃疡等原因引起的，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。
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