小便输精管疼痛可以通过一般治疗、药物治疗、物理治疗、手术治疗、中医治疗等方式进行治疗，需要根据引起的病因进行治疗。
1、一般治疗
如果是长期憋尿导致的，可以通过多喝温水的方式进行改善，也可以多进行体育锻炼，比如跑步、打篮球等，从而促进体内的血液循环，在一定程度上也可以改善疼痛的症状。
2、药物治疗
如果是输精管炎造成的，可以在医生的指导下服用盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢拉定胶囊等药物进行治疗，有利于改善病情。如果疼痛比较严重，还可以遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊、塞来昔布胶囊等药物进行治疗。
3、物理治疗
如果症状比较严重，还可以通过热毛巾热敷的方式进行改善，也可以通过按摩的方式进行处理，从而促进局部的血液循环，在一定程度上也可以缓解疼痛的症状。
4、手术治疗
如果是精索静脉曲张引起的，可以通过精索静脉曲张高位结扎术、精索内静脉栓塞术等方式进行治疗，也可以通过输精管切除术的方式进行改善。
5、中医治疗
患者还可以在医生的指导下通过中医理疗的方式进行辅助治疗，比如针灸、艾灸、按摩等，可以促进局部的血液循环，也可以达到疏通经络的目的。
如果症状比较严重，建议患者及时到正规医院的男科进行检查并治疗，以免延误病情。
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