男性衣原体感染多久能自愈,要根据患者的具体情况决定 。多数情况下经过四周左右的时间可以自愈,若相关不适症状消失,即使治愈在没有做好性保护的情况下,也可能会再次被感染。若药物疗程不足,治疗不彻底,也容易导致症状反复发生。需要辅助分泌物涂片化验检查,明确诊断后,根据个体情况,制定适宜的疗程。