芽孢杆菌和乳酸菌通常可以混合使用，因为二者所含的药物成分之间没有什么明显的冲突，一起使用一般不会引起身体不适，但需遵医嘱用药。
芽孢杆菌是一种革兰氏阳性菌，广泛存在于人体的肠道中，可以促进胃肠道的蠕动，改善便秘情况，同时还能够维持肠道菌群的平衡。而乳酸菌是一种有益菌，可以调节肠道菌群，改善腹泻、腹胀等不适症状。因此这两种药物可以一起混合使用，一般不会引起身体不适。但要注意的是，在使用时应遵循医嘱，避免自行盲目用药。
建议患者在使用药物期间要注意饮食清淡，避免食用辛辣刺激性食物，如辣椒、花椒等。如果期间出现明显不适，还需及时就医诊治，以免延误病情。
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