肝门部胆管癌切除后有转移风险。由于肝门部胆管癌的恶性程度较高,且容易侵犯周围组织和淋巴结,因此即使进行了手术切除,仍有可能发生转移。为了降低转移的风险,术后应密切监测并采取适当的辅助治疗措施,如放疗、化疗等。