药流不干净进行清宫是否会很痛，需要根据具体情况进行判断。若是药物流产完全，一般不会出现疼痛症状，若是药物流产不完全，可能会出现疼痛症状。
1、不会疼痛
药物流产是通过药物的方式促进胚囊、蜕膜组织、子宫内膜碎片排出体外，从而达到终止妊娠的目的。如果患者在进行药物流产完全，而且子宫内膜恢复良好，一般不会出现疼痛症状。
2、会疼痛
如果患者在药物流产不完全，子宫内膜恢复不好，可能会出现持续性的子宫收缩，此时进行清宫手术，可能会出现疼痛症状。而且每个人对疼痛的敏感程度不同，对于疼痛的感受也是不同的，所以具体情况还需要根据个人的体质来进行判断。
建议患者在进行药物流产后需要注意保持外阴清洁卫生，每天勤换内裤以及清洗外阴，以免引起感染的情况。同时，患者在进行药物流产后需要避免食用辛辣刺激性食物，如辣椒、花椒等，以免引起腹痛、腹泻等不适症状。
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