怀孕40天做B超看不到孕囊可能是宫外孕，但也不排除是生化妊娠、异位妊娠等原因导致的。
1、宫外孕
如果受精卵着床在子宫外，会出现怀孕40天做B超看不到孕囊的现象。建议患者可以通过血液检查、尿液检查等方式明确诊断。
2、生化妊娠
生化妊娠是指受精卵结合成功，但由于受精卵质量差或胚胎染色体异常等原因导致受精卵无法着床，从而出现怀孕40天做B超看不到孕囊的情况。
3、异位妊娠
异位妊娠是指受精卵在子宫腔外着床发育的异常妊娠过程，可能与输卵管炎症、输卵管发育不良等因素有关。患者可能会出现阴道流血、腹痛等症状，通过B超检查可能会出现看不到孕囊的现象。
除此之外，还可能是葡萄胎等原因导致的，建议患者及时就医治疗，以免延误病情。
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