甲基硫氧嘧啶和丙基硫氧嘧啶的区别，主要在于作用机制不同、不良反应不同、禁忌不同、药物相互作用不同、治疗不同等。
1、作用机制不同
甲基硫氧嘧啶是一种硫脲类的抗甲状腺药物，可以抑制甲状腺内过氧化物酶，从而达到治疗甲状腺功能亢进症的效果。而丙基硫氧嘧啶是一种硫脲类的抗甲状腺药物，可以抑制甲状腺内过氧化物酶，从而达到治疗甲状腺功能亢进症的效果。
2、不良反应不同
甲基硫氧嘧啶在服用后，可能会使患者出现粒细胞减少、血小板减少、皮疹、皮肤瘙痒等不良反应。而丙基硫氧嘧啶服用后，可能会使患者出现恶心、呕吐、腹泻、头痛、头晕、关节疼痛等不良反应。
3、禁忌不同
对甲基硫氧嘧啶过敏的患者、哺乳期女性、妊娠期女性等人群应禁止使用上述药物。而丙基硫氧嘧啶则通常对肝功能不全、严重白细胞减少、骨髓抑制等患者禁止使用。
4、药物相互作用不同
甲基硫氧嘧啶与抗凝药物合用，会增加抗凝药物的作用，从而导致患者出现牙龈出血、鼻出血等不良反应。而丙基硫氧嘧啶与磺胺类药物合用，会减少磺胺药在肝脏的排泄，从而使血药浓度升高，导致患者出现皮疹、发热、腹泻等不良反应。
5、治疗不同
甲基硫氧嘧啶主要用于治疗甲状腺功能亢进症，而丙基硫氧嘧啶主要用于治疗甲状腺功能亢进症。
另外，建议患者在医生指导下使用上述药物，不可自行盲目用药，以免引起不良反应，对身体造成损伤。如果患者服用药物后出现不适症状，建议及时就医治疗。
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