低聚半乳糖和低聚果糖的区别主要在于化学组成、应用、功能主治等方面。
1、化学组成
低聚半乳糖是由2-7个单糖通过β-1，4-苷键连接而成的低聚糖，属于大分子糖。而低聚果糖是由果糖和半乳糖以1.7-3.0%的比例组成的，属于小分子糖。
2、应用
低聚半乳糖广泛应用于食品、医药和保健品中，可用于食品加工的乳化剂、增稠剂和稳定剂等。低聚半乳糖还可用于医药工业，可提高抗菌药物的稳定性，在抗生素的稳定性维护方面有一定作用。低聚半乳糖还可在医药工业中用于治疗腹泻，可促进胃肠道蠕动，改善便秘，还可在化妆品中用作稳定剂。
3、功能主治
低聚半乳糖可以促进肠道有益菌的增殖，抑制有害菌的生长，还可以促进双歧杆菌的生长，改善肠道菌群失调的情况，从而起到改善腹泻、腹胀、消化不良等症状的作用。而低聚果糖可以促进肠道有益菌的增殖，还可以促进双歧杆菌的生长，改善肠道菌群失调的情况，从而起到改善便秘、腹泻、消化不良等症状的作用。
4、其他
虽然低聚半乳糖和低聚果糖都属于天然的益生元，但是低聚半乳糖还可用于制作益生菌、维生素、矿物质等保健品。而低聚果糖不能用于治疗疾病，但可用于预防和治疗便秘。
此外，对低聚半乳糖和低聚果糖过敏的人群应避免食用，以免引起过敏反应，出现皮疹、瘙痒等不适症状。如果食用后出现不适症状，建议患者及时就医治疗。
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